inquirybg

Себаткило, Аваш, Эфиопиядагы Anopheles чиркейлеринин геномдук популяциялык генетикасы жана инсектициддерге туруктуулугуна молекулярдык мониторинг

2012-жылы Жибутиде табылгандан бери Азиялык Anopheles stephensi чиркейи бүтүндөй Африка мүйүзүнө тарады. Бул инвазивдик вектор бүт континент боюнча жайылышын улантууда, бул безгекке каршы күрөшүү программаларына олуттуу коркунуч туудурат. Векторлор менен күрөшүү ыкмалары, анын ичинде инсектициддер менен дарыланган керебет торлору жана үй ичиндеги калдыктарды чачуу безгек оорусунун жүгүн бир кыйла азайтты. Бирок, инсектициддерге туруктуу чиркейлердин, анын ичинде Anopheles stephensi популяциясынын көбөйүшү безгекти жок кылуу боюнча жүргүзүлүп жаткан аракеттерге тоскоол болууда. Популяциянын структурасын, популяциялар арасындагы гендердин агымын жана инсектициддерге туруктуу мутациялардын бөлүштүрүлүшүн түшүнүү безгекке каршы күрөшүүнүн натыйжалуу стратегияларын жетектөө үчүн зарыл.
Кантип биздин түшүнүгүбүздү жакшыртуу Ан. Стефенси HOAда ушунчалык орноду, анын жаңы аймактарга жайылышын алдын ала айтуу үчүн абдан маанилүү. Популяциялык генетика популяциянын структурасын, уланып жаткан тандоону жана ген агымын18,19 түшүнүү үчүн вектордук түрлөрдү изилдөө үчүн кеңири колдонулган. Ан үчүн. Stephensi, популяциянын структурасын жана геномдун түзүлүшүн изилдөө анын басып алуу жолун жана пайда болгондон бери болгон ар кандай адаптация эволюциясын тактоого жардам берет. Ген агымынан тышкары, тандоо өзгөчө маанилүү, анткени ал инсектициддерге туруштук берүү менен байланышкан аллелдерди аныктай алат жана бул аллельдер популяция аркылуу кантип жайылып жатканына жарык бере алат20.
Бүгүнкү күнгө чейин, Anopheles stephensi инвазиялык түрлөрүндө инсектициддерге туруктуулук маркерлерин жана популяциянын генетикасын сыноо бир нече талапкер гендер менен чектелди. Түрдүн Африкада пайда болушу толук түшүнүлө элек, бирок бир гипотеза аны адамдар же мал киргизген деген божомол бар. Башка теориялар шамал аркылуу алыскы миграцияны камтыйт. Бул изилдөөдө колдонулган эфиопиялык изоляттар Аддис-Абебадан 200 км чыгышта жана Аддис-Абебадан Жибутиге чейинки негизги транспорттук коридордо жайгашкан Аваш Себат Кило шаарында чогултулган. Awash Sebat Kilo — безгектин таралышы жогору аймак жана Anopheles stephensi популяциясынын көп саны бар, ал инсектициддерге туруштук бере алат, бул аны Anopheles stephensi8 популяциясынын генетикасын изилдөө үчүн маанилүү жер кылат.
Kdr L1014F инсектицидге туруштук берүүчү мутация Эфиопия популяциясында төмөн жыштыкта ​​аныкталган жана Индиянын талаа үлгүлөрүндө табылган эмес. Бул kdr мутация пиретроиддерге жана ДДТга каршылык көрсөтөт жана мурда Анда аныкталган. stephensi популяциялары 2016-жылы Индияда жана 2018-жылы Ооганстанда чогултулган.31,32 Эки шаарда тең пиретроиддик каршылыктын кеңири таралганына карабастан, kdr L1014F мутациясы бул жерде талданган Мангалор жана Бангалор популяцияларында аныкталган эмес. Бул SNP алып жүрүүчү эфиопиялык изоляттардын гетерозиготалуу болгон төмөн үлүшү мутация бул популяцияда жакында пайда болгонун көрсөтүп турат. Бул Awashдагы мурунку изилдөө тарабынан колдоого алынган, бул жерде анализделгендерге чейинки жылы чогултулган үлгүлөрдөгү kdr мутациясынын эч кандай далили табылган эмес.18 Биз мурда ушул kdr L1014F мутациясын төмөнкү жыштыктагы бир эле аймактан/жыл үлгүлөрүнүн топтомунда аныктаганбыз. өзгөртүү бул байкалган фенотип үчүн жооптуу болуп саналат.
Бул изилдөөнүн чектөөсү инсектициддердин реакциясы боюнча фенотиптик маалыматтардын жоктугу болуп саналат. Бул мутациялардын инсектициддердин реакциясына тийгизген таасирин изилдөө үчүн бүт геномдун секвенциясын (WGS) же максаттуу ампликондун секвенциясын сезгичтиктин биоанализдери менен айкалыштырган кийинки изилдөөлөр керек. Каршылык менен байланышкан бул жаңы missense SNPs мониторингди колдоо жана каршылык фенотиптери менен байланышкан потенциалдуу механизмдерди түшүнүү жана текшерүү үчүн функционалдык ишти жеңилдетүү үчүн жогорку өтүмдүү молекулярдык анализдерге багытталышы керек.
Кыскача айтканда, бул изилдөө континенттер боюнча Anopheles чиркей популяциясынын генетикасын тереңирээк түшүнүүгө мүмкүндүк берет. Бүтүндөй геномдун секвенирлөө (WGS) анализин ар кандай географиялык аймактардагы үлгүлөрдүн чоңураак когорттарына колдонуу гендердин агымын түшүнүү жана инсектициддерге туруктуулуктун маркерлерин аныктоо үчүн ачкыч болот. Бул билим коомдук саламаттыкты сактоо органдарына векторлорду көзөмөлдөө жана инсектициддерди колдонууда негизделген тандоо жасоого мүмкүндүк берет.
Бул маалымат топтомундагы көчүрмө санынын өзгөрүшүн аныктоо үчүн биз эки ыкманы колдондук. Биринчиден, биз геномдогу аныкталган CYP ген кластерлерине багытталган камтууга негизделген ыкманы колдондук (Кошумча таблица S5). Үлгү камтуусу чогултулган жерлер боюнча орточо алынган жана төрт топко бөлүнгөн: Эфиопия, Индия талаалары, Индия колониялары жана Пакистан колониялары. Ар бир топ үчүн камтуу ядро ​​текшилөө аркылуу нормалдаштырылган жана андан кийин ошол топ үчүн медианалык геномдун камтуу тереңдигине ылайык график түзүлдү.


Посттун убактысы: 23-июнь-2025