суроо-талап

Эфиопиянын Авашан шаарындагы Себаткилодогу Анофелес чиркейлеринин инсектициддерге туруктуулугунун геном боюнча популяциялык генетикасы жана молекулярдык мониторинги

2012-жылы Джибутиде табылгандан бери, азиялык Anopheles stephensi чиркейи Африка мүйүзүнө жайылып кетти. Бул инвазивдүү вектор континент боюнча жайылып, безгекке каршы күрөшүү программаларына олуттуу коркунуч келтирип жатат. Инсектициддер менен иштетилген төшөк торлорун жана үйдүн ичинде калдыктарды чачууну камтыган векторлорду көзөмөлдөө ыкмалары безгектин жүгүн бир топ азайтты. Бирок, Anopheles stephensi популяцияларын кошо алганда, инсектициддерге туруктуу чиркейлердин көбөйүшү безгекти жок кылуу боюнча уланып жаткан аракеттерге тоскоол болууда. Популяциянын түзүмүн, популяциялардын ортосундагы ген агымын жана инсектициддерге туруктуу мутациялардын таралышын түшүнүү безгекке каршы күрөшүүнүн натыйжалуу стратегияларын жетектөө үчүн абдан маанилүү.
An. stephensi HOAда кантип мынчалык орноп калганын түшүнүүбүздү жакшыртуу анын жаңы аймактарга потенциалдуу жайылышын алдын ала айтуу үчүн абдан маанилүү. Популяциялык генетика вектордук түрлөрдү изилдөө үчүн популяциянын түзүлүшүн, уланып жаткан тандоону жана ген агымын түшүнүү үчүн кеңири колдонулган18,19. An. stephensi үчүн популяциянын түзүлүшүн жана геномунун түзүлүшүн изилдөө анын инвазия жолун жана ал пайда болгондон бери болгон адаптациялык эволюцияны аныктоого жардам берет. Ген агымынан тышкары, тандоо өзгөчө маанилүү, анткени ал инсектициддерге туруктуулук менен байланышкан аллелдерди аныктап, бул аллелдердин популяция аркылуу кантип жайылып жатканын түшүндүрө алат20.
Бүгүнкү күнгө чейин Anopheles stephensi инвазивдик түрүндөгү инсектициддерге туруктуулук маркерлерин жана популяциялык генетиканы текшерүү бир нече талапкер гендер менен гана чектелди. Түрдүн Африкада пайда болушу толук түшүнүктүү эмес, бирок бир гипотеза - ал адамдар же мал тарабынан киргизилген. Башка теорияларга шамал аркылуу алыскы аралыкка миграция кирет. Бул изилдөөдө колдонулган эфиопиялык изоляттар Аддис-Абебадан 200 км чыгышта жана Аддис-Абебадан Джибутиге чейинки негизги транспорттук коридордо жайгашкан Аваш Себат Кило шаарынан чогултулган. Аваш Себат Кило - безгектин жугушу жогору болгон аймак жана Anopheles stephensi популяциясы көп, ал инсектициддерге туруктуу деп айтылат, бул аны Anopheles stephensi8 популяциясынын генетикасын изилдөө үчүн маанилүү жайга айлантат.
Инсектициддерге туруктуулук мутациясы kdr L1014F эфиопиялык популяцияда төмөнкү жыштыкта ​​аныкталган жана Индиянын талаа үлгүлөрүндө аныкталган эмес. Бул kdr мутациясы пиретроиддерге жана ДДТга туруктуулукту берет жана мурда 2016-жылы Индияда жана 2018-жылы Ооганстанда чогултулган An. stephensi популяцияларында аныкталган.31,32 Эки шаарда тең пиретроиддерге туруктуулук кеңири таралгандыгына карабастан, kdr L1014F мутациясы бул жерде талданган Мангалор жана Бангалор популяцияларында аныкталган эмес. Бул SNP алып жүрүүчү эфиопиялык изоляттардын гетерозиготалуу үлүшүнүн төмөндүгү мутация бул популяцияда жакында эле пайда болгонун көрсөтүп турат. Муну Аваштагы мурунку изилдөө тастыктайт, анда бул жерде талданган үлгүлөрдөн бир жыл мурун чогултулган үлгүлөрдө kdr мутациясынын эч кандай далили табылган эмес.18 Биз мурда бул kdr L1014F мутациясын ампликонду аныктоо ыкмасын колдонуп, ошол эле аймактан/жылдан алынган үлгүлөрдүн топтомунда төмөнкү жыштыкта ​​аныктаганбыз.28 Үлгү алуу жерлериндеги фенотиптик каршылыкты эске алганда, бул каршылык көрсөтүү маркеринин аллель жыштыгынын төмөндүгү бул байкалган фенотип үчүн максаттуу жердин модификациясынан башка механизмдер жооптуу экенин көрсөтүп турат.
Бул изилдөөнүн бир чектөөсү инсектициддерге болгон реакция боюнча фенотиптик маалыматтардын жоктугу болуп саналат. Бул мутациялардын инсектициддерге болгон реакцияга тийгизген таасирин изилдөө үчүн бүтүндөй геномду секвенирлөөнү (WGS) же максаттуу ампликонду секвенирлөөнү сезгичтик биоанализдери менен айкалыштырган андан аркы изилдөөлөр талап кылынат. Каршылык көрсөтүү менен байланыштуу болушу мүмкүн болгон бул жаңы миссенс SNPлер мониторингди колдоо жана каршылык көрсөтүү фенотиптери менен байланышкан потенциалдуу механизмдерди түшүнүү жана текшерүү боюнча функционалдык иштерди жеңилдетүү үчүн жогорку өндүрүмдүүлүктөгү молекулярдык анализдер үчүн максаттуу болушу керек.
Кыскасы, бул изилдөө континенттердеги Anopheles чиркейлеринин популяциясынын генетикасын тереңирээк түшүнүүгө мүмкүндүк берет. Ар кандай географиялык аймактардагы үлгүлөрдүн чоңураак когорталарына бүтүндөй геномду ырааттуулукка (WGS) талдоону колдонуу ген агымын түшүнүү жана инсектициддерге туруктуулуктун маркерлерин аныктоо үчүн маанилүү болот. Бул билим коомдук саламаттыкты сактоо органдарына векторлорду көзөмөлдөө жана инсектициддерди колдонууда маалыматтуу тандоолорду жасоого мүмкүндүк берет.
Бул маалыматтар топтомунда көчүрмө санынын өзгөрүшүн аныктоо үчүн биз эки ыкманы колдондук. Биринчиден, биз геномдогу аныкталган CYP ген кластерлерине багытталган камтууга негизделген ыкманы колдондук (S5 кошумча таблицасы). Үлгү камтуусу чогултуу жерлери боюнча орточо эсептелип, төрт топко бөлүндү: Эфиопия, Индия талаалары, Индия колониялары жана Пакистан колониялары. Ар бир топ үчүн камтуу ядрону тегиздөө аркылуу нормалдаштырылып, андан кийин ошол топ үчүн геномду камтуунун орточо тереңдигине ылайык график боюнча сызылган.


Жарыяланган убактысы: 2025-жылдын 23-июну