inquirybg

Геномдун жалпы ассоциациясы MAMP тарабынан алынган коргонуу реакциясынын күчүн жана соргодогу максаттуу жалбырак тактарына каршылык көрсөтүүнү талдоо

Өсүмдүк жана патогендик материалдар

Иллинойс университетинде (азыркы Дэвис университетинде) доктор Пэт Браун тарабынан сорго конверсиясынын популяциясы (SCP) катары белгилүү болгон сорго ассоциациясы популяциянын картасын түзгөн.Бул мурда сүрөттөлгөн жана АКШнын чөйрөлөрүндө өсүмдүктөрдүн өсүшүн жана өнүгүшүн жеңилдетүү үчүн фотопериодго сезгичтикке жана кичине бойго айланган түрдүү сызыктардын жыйындысы.Бул изилдөөдө бул популяциянын 510 линиясы колдонулган, бирок начар өнүү жана башка сапатты көзөмөлдөө маселелеринен улам, бардык үч белгини талдоодо бардык сызыктар колдонулган эмес.Акыр-аягы, 345 саптан алынган маалыматтар хитин реакциясын талдоо үчүн, 472 сап flg22 реакциясы жана 456 сап TLS каршылыгы үчүн колдонулган.B. cookeiLSLP18 штаммы Арканзас университетинде доктор Берт Блюмден алынган.

MAMP жооп өлчөө

Бул изилдөөдө эки башка MAMP колдонулган flg22, (Genscript catalog# RP19986) жана chitin .Сорго өсүмдүктөрү күнөсканада топурак менен толтурулган батирлерге (33% Sunshine Redi-Earth Pro Growing Mix) төшөлгөн кыстармаларда өстүрүлгөн.Өсүмдүктөр жыйноо күнү ашыкча жалбырак нымдуулугуна жол бербөө үчүн үлгү алуудан бир күн мурун сугарылды.

Линиялар рандомизацияланган жана логистикалык себептерден улам 60 линиядан турган партияларга отургузулган.Ар бир сапка үч «казан» экиден урук себилген.Кийинки партиялар мурунку партия иштетилгенден кийин бүт популяцияга баа берилгенге чейин отургузулган.Эки эксперименталдык чуркоо генотиптери эки жолдун ар биринде рандомизацияланган эки MAMP үчүн өткөрүлдү.

ROS анализдери мурда айтылгандай жүргүзүлдү.Кыскача айтканда, ар бир линияга алты урук 3 башка идишке отургузулган.Пайда болгон көчөттөрдүн ичинен үчөө бирдейлигине карап тандалып алынган.Көпчүлүккө караганда адаттан тыш көрүнгөн же бир кыйла узун же кыска көчөттөр колдонулган эмес.Диаметри 3 мм болгон төрт жалбырак дисктери үч түрдүү 15 күндүк кумурска өсүмдүктөрүнүн 4-жалбырагынын эң кеңири бөлүгүнөн кесилген.Эки өсүмдүктөн бир жалбырактан бир диск жана бир өсүмдүктөн эки диск, экинчи диск сууну башкаруучу болуп калат (төмөндө караңыз).Дисктер 50 мкл H20 боюнча 96 көзөнөктүү кара пластинкага өзүнчө сүзүп, жарыкка тийбеш үчүн алюминий пломба менен жабылып, түнү бою бөлмө температурасында сакталган.Эртеси эртең менен реакция эритмеси 2 мг/мл хемилюминесценттик зонд L-012 (Wako, каталог № 120-04891), 2 мг/мл хрен пероксидазасы (VI-A түрү, Сигма-Алдрих, каталог № P6782) жана 100 мг/мл хитин же 2 мкм Flg22.Бул реакциянын эритмесинен 50 мкл төрт көзөнөктүн үчөөнө кошулган.Төртүнчү скважина жасалма башкаруу болгон, ага MAMP кошулбаган реакциялык эритме кошулган.Ар бир табакка суу гана камтыган төрт бош кудук да киргизилген.

Реакция эритмеси кошулгандан кийин, люминесценция SynergyTM 2 көп аныктоочу микропластинаны окуучу (BioTek) ар бир 2 мүнөт сайын 1 саат бою өлчөнгөн.Пластина окугуч бул 1 сааттын ичинде ар бир 2 мүнөт сайын люминесценцияны өлчөөдө.Бардык 31 көрсөткүчтөрдүн суммасы ар бир скважина үчүн баа берүү үчүн эсептелген.Ар бир генотип үчүн MAMP жоопунун болжолдуу мааниси (үч эксперименталдык скважинанын орточо люминесценция мааниси — жасалма скважинанын мааниси) - минус орточо бош скважинанын мааниси катары эсептелген.Бош скважиналардын баалуулуктары дайыма нөлгө жакын болгон.

жалбырак дисктериNicotiana benthamiana, сапатты көзөмөлдөө максатында ар бир 96 скважиналуу пластинкага көзөмөл катары бир жогорку жооп берүүчү сорго линиясы (SC0003) жана бир аз жооп берүүчү сорго линиясы (PI 6069) киргизилген.

B. cookeiинокуляцияны даярдоо жана эмдөө

B. cookeiэмдөө мурда айтылгандай даярдалган.Кыскача айтканда, сорго дандары үч күн бою сууга чыланган, чайкалып, 1 л конус түрүндөгү колбаларга куюлган жана 15psi жана 121 °C температурада бир саат бою автоклавда сакталган.Андан кийин дандарга жаңы культурадан алынган 5 млдей мацерацияланган мицелия себилдиB. cookeiLSLP18 бөлүп чыгарып, 2 жумага бөлмө температурасында калтырып, ар бир 3 күндө колбаларды чайкап коюшат.2 жумадан кийин козу карынга чалдыккан сорго дандары абада кургатылган жана андан кийин талаада эмдөө башталганга чейин 4 °C температурада сакталган.Ошол эле эмдөө бүт сыноо үчүн колдонулган жана жыл сайын жаңы жасалган.Эмдөө үчүн 4-5 жумалык кумурска өсүмдүктөрүнүн түбүнө 6-10 жугуштуу дан салынган.Бул козу карындардан пайда болгон споралар бир жуманын ичинде жаш сорго өсүмдүктөрүнө инфекцияны козгогон.

Үрөн даярдоо

Талаага себүү алдында сорго үрөнү фунгицид, инсектицид жана ~ 1% Spirato 480 FS фунгицид, 4% Sebring 480 FS фунгицид, 3% Sorpro 940 ES үрөн коопсуздугу камтыган аралашма менен дарыланган.Андан кийин уруктар 3 күн бою абада кургатылган, бул аралашма уруктардын айланасында жука капталган.Сактоочу Dual Magnum гербицидин пайда болгонго чейинки дарылоо катары колдонууга уруксат берди.

Максаттуу жалбырак тактарынын каршылыгын баалоо

SCP 2017-жылдын 14-15-июнунда жана 2018-жылдын 20-июнунда Клейтондогу Борбордук Өсүмдүктөрдү изилдөө станциясында ар бир учурда эки эксперименталдык кайталоо менен рандомизацияланган толук блок дизайнында отургузулган.Тажрыйбалар ар бир участокко 10 урук колдонуу менен 0,9 м катар туурасы менен 1,8 м жалгыз катарларга себилди.Чектик эффекттерди болтурбоо үчүн ар бир эксперименттин четине эки чек ара катар отургузулган.Тажрыйбалар 2017-жылдын 20-июлунда жана 2018-жылдын 20-июлунда себилген, ал учурда сорго өсүмдүктөрү 3-өсүү стадиясында болчу. Рейтингдер бирден тогузга чейинки шкала боюнча алынды, мында оорунун белгилери жок өсүмдүктөр тогуз жана толугу менен бааланды. өлүк өсүмдүктөр бир катары бааланды.2017-жылы эки рейтинг жана 2018-жылы төрт окуу жыл сайын эмдөөдөн эки жума өткөндөн кийин алынган.sAUDPC (оорунун өрчүшүнүн ийри сызыгынын астындагы стандартташтырылган аймак) мурда айтылгандай эсептелген.


Посттун убактысы: 01-01-2021